حوزههای علمیه خواهران نسبت به حوزههای علمیه برادران که قریب به ۱۱ قرن فعالیت داشته، جوان است و تنها ۲۲ سال است که به صورت رسمی فعالیت خود را آغاز کرده، اما خوشبختانه جایگاه خود را پیدا کرده و در حال حاضر قریب به ۵۰۰ مدرسه علمیه خواهران در سراسر کشور وجود دارد.